Τα πρώτα κτίρια στο δάσος Περτουλίου κατασκευάσθηκαν το 1940 και περιελάμβαναν ένα κτίριο Διοίκησης (Δασαρχείο) και ένα Δασοφυλάκιο.
Με τον πόλεμο του 1940, αλλά και στη συνέχεια με τον εμφύλιο, τα κτίρια καταστράφηκαν λόγω βομβαρδισμών και η υπηρεσία έπαψε να λειτουργεί.
Με την εκ νέου ίδρυση της Υπηρεσίας το 1951, ως Ταμείο Διοικήσεως και Διαχειρίσεως Πανεπιστημιακών Δασών, ξεκίνησαν να χτίζονται οι πρώτες εγκαταστάσεις σε αρχιτεκτονικά σχέδια του διάσημου αρχιτέκτονα Πικιώνη, καθηγητή του Εθνικού Μετσόβειου Πολυτεχνείου, τα οποία ολοκληρώθηκαν το 1966. Συνολικά χτίστηκαν 12 διαφορετικά πέτρινα οικήματα.
